O custo operacional é um dos parâmetros mais críticos de decisão para seleção de uma tecnologia de tratamento de resíduos ou efluentes, principalmente o custo de energia elétrica. Porém, nem sempre esse parâmetro é levado em conta, muitas vezes porque o construtor não será o operador do sistema e não incorrerá nesses custos. Mas para o dono do empreendimento complexidade e custo operacional são variáveis críticas. Sistemas de alto consumo de energia, grande quantidade de equipamentos, alta complexidade operacional e alto consumo de químicos tendem a ser bem mais caros ao longo do seu ciclo de vida, independente do valor inicial de investimento. Por ser um reator de nano-membrana fixa, o reator BioGill não possui sistema de aeração. A energia elétrica requerida é somente para a operação das bombas de recirculação dos efluentes. Além disso, por sua configuração de tecnologia passiva - estático e com ausência de partes moveis - o sistema BioGill é muito simples de operar.